Série documentaire ' Dans le secret des pierres ' permet de découvrir différents sites archéologiques méconnus à travers le monde ainsi que l'histoire qui a présidé leur construction. Grâce aux connaissances accumulées par les archéologues et aux images de synthèse, le téléspectateur peut s'imaginer le monument tel qu'il était habité à son origine.
Ornithologue, Michel Terrasse part à la recherche des espèces qui peuplent les côtes péruviennes. Plus à l'ouest, Nicolas Hulot se lance sur les traces de la civilisation inca. La cité de Machu Picchu livre ses trésors archéologiques. Anne Gély, biologiste spécialiste de l'Amazonie, approche avec précaution les nids des colibris. Plus à l'est, au coeur de la forêt péruvienne, les perroquets multicolores de Tambopata s'ébattent en toute quiétude. A l'autre bout du monde, au Japon, sur la presqu'île d'Hokkaido, les grues improvisent un ballet sur la neige. Rien d'équivalent pour le condor en Argentine. Luis Jacome, Nicolas Hulot et Michel Terrasse se retrouvent dans la vallée Encantado, où le majestueux oiseau a décidé de nicher.